مشکلات تیروئید و اتوایمنی بر روی باروری و حاملگی تاثیرات مهمی دارند. لذا در زنان یکی از تست‌های روتین بررسی ناباروری و سقط مکرر، بررسی‌های تیروئیدی و در درجه دوم آنتی‌بادی‌های ضد تیروئید می‌باشد.هورمون‌های اصلی تیروئید T3 و T4 بوده که با ترشح TSH از هیپوفیز کنترل می‌گردند.

 این هورمون‌ها امروزه در آزمایشگاه با استفاده از روش‌های ایمنواسی بررسی می‌شوند. با توجه به اینکه قسمت اصلی و عملکردی هورمون تیروئید قسمت آزاد آن است و قسمت توتال می‌تواند بسته به حالات فیزیولوژیک مثل حاملگی و حالات مرضی مثل بیماری‌های کبد و کلیه تغییر کند بهترست قسمت آزاد هورمون تیروئید اندازه‌گیری شود.

TSH تست طلایی بررسی عملکرد تیروئید است که بهتراست همراه با بررسی T4 (آزاد) انجام شود. از سایر فاکتورهایی که در تیروئید بررسی می‌شود تیروگلوبولین می‌باشد که در بررسی پروگنوز و پاسخ به درمان در بدخیمی‌ها مطرح است.

در بررسی‌های تیروئید دو فاکتور اتوایمنی نیز مطرح می‌باشند که عبارتند از آنتی‌تیروگلوبولین آنتی‌بادی و آنتی‌TPO یا آنتی‌میکروزومال آنتی‌بادی. این دو آنتی‌بادی در افراد سالم و طبیعی نیز به میزان 10-5% وجود دارند و در زنان با افزایش سن این درصد بالاتر نیز می‌رود.

 در موارد دیگری از اتوایمنی تیروئید مثل هاشیموتو، گریوز و میکزدم این آنتی‌بادی‌ها افزایش می‌یابند؛ بنابراین یکی از راه‌های تشخیصی در بیماری‌ها، اندازه‌گیری این آنتی‌بادی‌ها می‌باشد. با توجه به اینکه این آنتی‌بادی‌ها حساس هستند اما اختصاصی نیستند. در بررسی ناباروری زنان یکی از آزمایشات اولیه، بررسی عملکرد تیروئید است زیرا پرکاری یا کم‌کاری تیروئید به طور مستقیم بر روی عملکرد دستگاه تولیدمثل خانم‌ها اثر می‌گذارد و تخمک‌گذاری را مختل می‌کند. البته بررسی‌ها نشان داده است که این تست‌ها در آقایان جزء بررسی‌های اولیه نیستند. اختلالات تیروئید بیشتر بر روی حرکت اسپرم اثر دارند تا بر روی تعداد و شکل.

 امروزه در بررسی ناباروری زنان علاوه بر عملکرد تیروئید، وجود آنتی‌بادی‌‌های ضد تیروئیدی نیز بررسی شود. در زمینه اهمیت بررسی عملکرد تیروئید در بررسی‌های ناباروری، مطالعات زیادی انجام گرفته است که به چند نمونه‌ از آن اشاره می‌شود.

در مطالعه‌ای که توسط Poppe K و همکارانش در بلژیک انجام گرفته است و در نشریه تیروئید سال 2002 به چاپ رسیده است؛ 438 زن نابارور به عنوان گروه نمونه و 100 زن بارور به عنوان گروه کنترل مورد بررسی قرار گرفته‌اند. در این بررسی تغییرات TSH در گروه نمونه نسبت به گروه کنترل بیشتر بود و آنتی‌TPO در گروه نمونه نسبت به گروه کنترل 18% به 8% بود. در مطالعه دیگری که توسط Grassi G انجام گرفته و در مجله Gynecol Endocrinol 2001 به چاپ رسیده است؛ 149 زن نابارور مورد بررسی قرار گرفتند که 1/20% از این زنان مشکل تیروئیدی و 4/17% آنتی‌بادی ضد تیروئیدی داشته‌اند.